Hola Miroslav,
Tiene razón Jose, con las notas que menciona ya aplica correctamente la distribución de previsión social, te comento, con los clientes que tengo saco un catalogo de los conceptos para hacer las agrupaciones, verifico que todos se encuentren contenidos, para verificar el cfdi, veo el campo de total que es igual al conceptos /560 o /559, para verificar que la suma de percepciones y deduciones este dando el valor correcto, si tratas de cuadrar las percepciones contra el recibo no va ser posible ya que hay conceptos como vales o cuotas imss absorbidas por el patrón que te descuadran el total de percepciones y como tienes que ponerla en deduciones para ajustar el otro lado tampoco te cuadra con el recibo, personalmente a mi me es mas fácil checar los datos por grupos.
Saludos,
Vero